根据《协议》，双方同意在台湾海峡北线航路的基础上开通南线和第二条北线双向直达航路，并继续磋商开通其他更便捷的新航路。

　　双方同意两岸航空公司可在对方区域通航地点设立代表机构，并自行或指定经批准的代理人销售航空运输凭证、从事广告促销及运行保障（运务）等与两岸航空运输有关的业务。上述代表机构的工作人员应遵守所在地规定。

　　根据《协议》附件，大陆方面同意在现有北京、上海（浦东）、广州、厦门、南京、成都、重庆、杭州、大连、桂林、深圳、武汉、福州、青岛、长沙、海口、昆明、西安、沈阳、天津、郑州等21个客运航点基础上，新增合肥、哈尔滨、南昌、贵阳、宁波、济南等6个客运航点。上述27个航点可经营客运定期航班。

　　台湾方面同意桃园与高雄航点可经营客运定期航班，其余包括台北松山、台中、澎湖（马公）、花莲、金门、台东等6个航点为客运包机航点。

　　大陆方面同意上海（浦东）、广州航点可经营货运定期航班，台湾方面同意桃园、高雄航点可经营货运定期航班。

    客运班次

　　双方同意客运定期航班和包机班次总量为每周共二百七十个往返班次，每方每周一百三十五个往返班次。其中以下航点每方每周往返班次不超过：1.大陆方面：上海（浦东）二十八班；北京十班；深圳十班；广州十四班；昆明十四班；成都十四班。2.台湾方面：台北松山二十一班。

　　其他航点可根据市场需求在航班总量范围内安排定期航班或包机。京华时报